El max_input_vars se puede configurar en su .htaccess, php.ini o wp-config.php archivo.
Recomendamos aumentar el valor por defecto a 3000 como mínimo.
Aquí tienes 3 formas de hacerlo:
.htaccess
php_value max_input_vars 3000
php.ini
max_input_vars = 3000
wp-config.php
@ini_set( 'max_input_vars' , 3000 );